A fin de demostrar ante la comunidad que su estructura organizativa, procedimientos, procesos y recursos cumplen en la práctica con el modelo internacional de gestión de calidad para empresas de servicio, en cuanto a su operación e instalaciones, NYCE cuenta con la certificación de su sistema de calidad con base en la norma ISO 9001:2000 para los procesos de certificación de producto de la industria electrónica y de la industria hulera y verificación de información comercial, reconocimiento que le fue otorgado al mismo tiempo por un organismo certificador nacional y por uno internacional.
Esta certificación representa para NYCE la obtención del Certificado IQNet, que otorga el reconocimiento internacional a su sistema de calidad. IQNet (International Certification Network, por sus siglas en inglés), es una red que agrupa a 36 organizaciones de certificación de sistemas de calidad con más de 200 subsidiarias en todo el mundo, las cuales reconocen automáticamente los certificados e informes de auditoría que realicen cualesquiera de sus miembros.
Adicionalmente NYCE se encuentra inscrito en el Registro Nacional de Instituciones y Empresas Científicas y Tecnológicas (RENIECYT), del Consejo Nacional de Ciencia y Tecnología (CONACYT), el cual es una base de datos de instituciones, centros, organismos, empresas y personas físicas de los sectores público, social y privado que realizan actividades científicas y tecnológicas, y forma parte del Sistema Integrado de Información sobre Investigación Científica y Tecnológica. Este Registro demuestra que NYCE realiza actividades a las que se refiere el artículo 17 de la Ley de Ciencia y Tecnología.
NYCE fue galardonado por CONCAMIN en dos ocasiones con el Premio Anual a la Ética y los Valores en la Industria: el 2003 y el 2004, en ambos casos, en la categoría de organismos de apoyo a la industria; reconocimientos que recibió de manos del entonces Presidente de la República, Lic. Vicente Fox Quezada.
Asimismo fue galardonado por la Entidad Mexicana con el Reconocimiento al Compromiso con la Acreditación 2009, por haber demostrado su entusiasmo y compromiso por mejorar y fortalecer las actividades de acreditación en México.
Los criterios a evaluar para ser merecedor del reconocimiento fueron: